Molekulardynamik: Grundlagen der Simulation großer Biomoleküle in Physik, Chemie und Biologie
Deutsch | 2025 | ISBN: 3662708620 | 370 Pages | PDF (True) | 12 MB
Deutsch | 2025 | ISBN: 3662708620 | 370 Pages | PDF (True) | 12 MB
Mittels Einführung und Anwendungsbeispiel werden die Lesenden schrittweise mit grundlegenden Aspekten von klassischen Molekulardynamik-Simulationen großer Biomoleküle vertraut gemacht. Das Ergebnis einer solchen Simulation, die sogenannte Trajektorie, lässt sich in einer anschaulichen Analogie mit einem „Film“ vergleichen: Dazu gehören im dritten Kapitel als „Akteure“ die Atome und Moleküle, im vierten als „Filmset“ die Simulationsboxen, im fünften als „Rollenbeschreibungen“ die klassischen Wechselwirkungsmodelle für die Atome und im sechsten als „Drehbuch“ die Algorithmen, die die Bewegungsgleichungen numerisch integrieren. Anschließend erfolgt der Einbezug von Begriffen aus der statistischen Mechanik und ein ausführlicher Anhang liefert für das Verständnis nützliche mathematische und physikalische Grundlagen.